какой проигрыватель их показывает ?
В оригинале Apple Quick Player, но в принципе достаточно установить пакет подходящих кодеков (K-Lite, например) и будет тебе счастье с любым плееров.
можно ли в фотоаппарате указать другой формат ави или ему подобные ?
Нельзя. Не видел ни одного аппарата с подобной опцией.
в чем разница между форматами ?
А оно тебе надо?
Разница в кодеках, в алгоритмах сжатия и т.д. и т.п. Mov - на сегодняшний день самый распостраненный формат в фото-мыльницах.